Лаборатория геоботаники ведет свое начало от Лаборатории геоботаники и систематики высших растений, организованной в 1962 г. при создании Биолого-почвенного института. В разное время в лаборатории были паредставлены такие направления исследований как геоботаническое картографирование, выявление естественной и антропогенной динамики растительного покрова, изучение продуктивности и классификация луговой и лесной растительности. Многие работы были направлены на оценку состояния и выработку рекомендаций по рациональному использованию растительных ресурсов. Эти исследования связаны с именами Г.Э.Куренцовой, К.Д. Степановой, Н.С.Шеметовой, М.А.Щербовой, А. Г. Крылова.