Изучением микробиологической трансформации нефтяных углеводородов занимается ст.н.с., к.б.н. Голодяев Г.П. В результате многолетних исследований из хронически нефтезагрязненных почв были выделены комплексы аборигенных почвенных микроорганизмов, адаптированных к высоким концентрациям нефтепродуктов и обладающих активным нефтеокисляющим действием На их основе создано 8 комплексных нефтеокисляющих препаратов универсального действия. По своей способности окислять нефтепродукты они на порядок активнее выпускаемого в России бактериального препарата "Путидойл". Штаммы микроорганизмов, входящих в комплексные нефтеокисляющие препараты, задепонированы в Институте физиологии и биохимии микроорганизмов РАН. На них получены патенты. Препараты экологически безопасны. Разработана технология очистки почв, почвогрунтов, морских и пресных вод загрязненных нефтепродуктами. Составлена инструкция по применению комплексных нефтеокисляющих препаратов, а так же технологическая схема наращивания биомассы нефтеокисляющих микроорганизмов в промышленных масштабах.      Второе направление, развиваемое д.б.н. Никитиной З.И. имеет прямое отношение к мониторингу состояния почвенных экосистем Дальнего Востока оценке их устойчивости в условиях хозяйственной деятельности, прогнозу и разработке мероприятий по предотвращению последствий негативного влияния амтропогеиного фактора на окружающую среду. Именно это направление исследований является основой санации почв, загрязненных тяжелыми металлами и другими химическими элементами. Определена экологическая устойчивость основных типов почв юга Дальнего Востока, степень их нарушенности и характер микробиологических изменений в зонах интенсивного сельскохозяйственного и промышленного воздействия. Микробиологический мониторинг техногенных территорий Приморья и Приамурья позволил установить протяженность зон промышленного прессинга, стоки тяжелых металлов из центров загрязнения, определить пороговые концентрации таких тяжелых металлов, как кадмий, свинец, медь, цинк. По содержанию резистентных к тяжелым металлам микроорганизмов установлена экологическая устойчивость природных экосистем, определены тенденции изменения функциональной структуры почвенной биоты. Для экспресс-контроля рекомендованы цветные маркеры микробиологических популяций. Изучаются механизмы микробиологической детоксикации тяжелых металлов.      Сотрудники группы микробиологии являются авторами более 150 публикаций, в том числе монографий: Голодяев Г.П., Иванов Г.И. "Биохимические очистки почв прибрежной зоны юга Дальнего Востока от нефтепродуктов", Владивосток, ДВО РАН. 6 п.л. Никитина З.И. "Микробиологический мониторинг наземных экосистем", Новосибирск, Наука, 1991, 219 с. Патенты: Голодяев Г.П. №20836667, №96119717, №96119716 на консорциумы штаммов микроорганизмов-деструкторов для очистки почв, почвогрунтов,вод от нефти,нефтепродуктов и остаточной замазученности.