В отделе три структурных подразделения: Лаборатория низших растений (10 человек). Лаборатория высших растений (12), Гербарий (6). Всего в штате отдела - 22 научных сотрудника, в том числе 6 докторов и 12 кандидатов наук. В отделе хранится крупнейшая в азиатской части региона коллекция низших и высших растений, общее количество которых превышает 550 тысяч единиц (гербарных листов и пакетов). Начало создания этой коллекции положено инициатором организации академического подразделения на востоке страны академиком В.Л.Комаровым. С 1974 г. коллекция зарегистрирована в международном каталоге гербариев мира под названием VLA.