В отделе осуществляется разработка двух долголетних проектов по подготовке многотомных фундаментальных сводок: "Сосудистые растения Дальнего Востока " (тт. 1-8, Наука: 1985-1996 гг.; всего томов в серии 10) и "Низшие растения, грибы и мохообразные Дальнего Востока" (тт. 1-4, Наука: 1990-1998 г.; всего томов в серии 20), в которых обобщены сведения о флоре, систематике, экологии и географии растений региона. Опубликованные тома обеих серий высоко оценены отечественными и зарубежными коллегами.      Сотрудниками отдела ботаники или с их активным участием изучена флора большинства заповедников региона, что позволяет вести работу по подготовке кадастров. Материалы сотрудников отдела использованы в Красной книге СССР и Красной книге РСФСР. Координация      Под эгидой отдела функционирует Приморское отделение Русского ботанического общества. Проводятся ежегодные мемориальные Комаровские чтения. Задачи на перспективу      Завершение издания многотомных сводок, подготовка книг по флоре отдельных субрегионов, продолжение изучения флор заповедных территорий.