Отдел эволюционной биологии объединяет специалистов по палеобиологии, цитогенетике, биохимической и молекулярной генетике. Отдел был основан проф. Н.Н.Воронцовым в 1971 г. и долгое время возглавлялся проф. В.А.Красиловым. Эволюционные исследования как теоретическая база современной биологии успешно развивается на юге Дальнего Востока благодаря исключительному разнообразию природных условий на границе континента и океана, богатству флоры и фауны, а также местонахождений ископаемых организмов. В отделе создан единственный в стране комплекс палеонтологических и эволюционно-генетических исследований, обеспеченный высококвалифицированными кадрами.      Кадровый состав: 30 человек, включая 3 докторов и 13 кандидатов наук. Целью совместной работы палеонтологов, изучающих макроэволюционные процессы, и генетиков, исследующих механизмы видообразования и эволюции генома, является всестороннее познание путей и закономерностей эволюции органического мира в региональном и общенаучном плане.