Отдел зоологии БПИ был создан в 1944 г. Его возглавил известный энтомолог и зоогеограф, проф. А. И. Куренцов. После организации Биолого-почвенного института в 1962 г. зоологический отдел, объединивший лаборатории экологии насекомых, гельминтологии и зоологии позвоночных животных, возглавил профессор Г.Ф. Бромлей, затем им руководили к.б.н. Ю.Л. Мамаев, к.б.н. А.С. Ерошенко; с 1990 г. отделом заведует д.б.н. Б.И. Лебедев.      В Отделе работали и такие известные ученые как проф. А.А. Емельянов, Н.И. Калабухов, В.Я. Леванидов, д.б.н. К.А.Воробьев и первый директор института - проф. П.Г. Ошмарин.      В Отделе, состоящем из 7 структурных лабораторий (паразитологии, фитонематологии, энтомологии, гидробиологии, экологии пресноводных сообществ, орнитологии, териологии) работает 71 специалист, в т.ч.- 1 член-корреспондент РАН (П.А. Лер), 11 докторов (В.В. Богатов, В.А. Костенко, В.Н. Кузнецов, Б.И. Лебедев, А.С. Лелей, И.М. Леванидова, E.А. Макарченко, А.А. Назаренко, В.А. Нечаев, С.Ю. Стороженко, М.П. Тиунов) и 27 кандидатов наук.